MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 30260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000921	GAGC	2	8	68	75	25 %	0 %	50 %	25 %	15611072
2	NC_000921	CATT	2	8	154	161	25 %	50 %	0 %	25 %	15611072
3	NC_000921	GAT	3	9	162	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611072
4	NC_000921	TG	3	6	178	183	0 %	50 %	50 %	0 %	15611072
5	NC_000921	T	6	6	299	304	0 %	100 %	0 %	0 %	15611072
6	NC_000921	AAAGCG	2	12	328	339	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15611072
7	NC_000921	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611072
8	NC_000921	T	7	7	358	364	0 %	100 %	0 %	0 %	15611072
9	NC_000921	T	7	7	386	392	0 %	100 %	0 %	0 %	15611072
10	NC_000921	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611072
11	NC_000921	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611072
12	NC_000921	C	6	6	440	445	0 %	0 %	0 %	100 %	15611072
13	NC_000921	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611073
14	NC_000921	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611073
15	NC_000921	C	6	6	682	687	0 %	0 %	0 %	100 %	15611073
16	NC_000921	CT	3	6	731	736	0 %	50 %	0 %	50 %	15611073
17	NC_000921	CTC	2	6	799	804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611073
18	NC_000921	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611073
19	NC_000921	TCTG	2	8	850	857	0 %	50 %	25 %	25 %	15611073
20	NC_000921	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611073
21	NC_000921	T	6	6	894	899	0 %	100 %	0 %	0 %	15611073
22	NC_000921	AAAT	2	8	952	959	75 %	25 %	0 %	0 %	15611074
23	NC_000921	CCG	4	12	1083	1094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611074
24	NC_000921	CCA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611074
25	NC_000921	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611074
26	NC_000921	CA	3	6	1266	1271	50 %	0 %	0 %	50 %	15611074
27	NC_000921	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	15611074
28	NC_000921	CTA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611074
29	NC_000921	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	15611074
30	NC_000921	GGC	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611074
31	NC_000921	GCTT	2	8	1495	1502	0 %	50 %	25 %	25 %	15611074
32	NC_000921	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	15611074
33	NC_000921	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611074
34	NC_000921	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611074
35	NC_000921	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611075
36	NC_000921	A	7	7	1817	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	15611075
37	NC_000921	ATTATA	2	12	1835	1846	50 %	50 %	0 %	0 %	15611075
38	NC_000921	CCTG	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	15611075
39	NC_000921	CCAA	2	8	1874	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	15611075
40	NC_000921	TTAT	2	8	1896	1903	25 %	75 %	0 %	0 %	15611075
41	NC_000921	TGAA	2	8	1914	1921	50 %	25 %	25 %	0 %	15611075
42	NC_000921	GTT	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611075
43	NC_000921	GC	3	6	1952	1957	0 %	0 %	50 %	50 %	15611075
44	NC_000921	T	6	6	2016	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	15611075
45	NC_000921	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611075
46	NC_000921	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611075
47	NC_000921	TCA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611075
48	NC_000921	AATG	2	8	2104	2111	50 %	25 %	25 %	0 %	15611075
49	NC_000921	G	6	6	2229	2234	0 %	0 %	100 %	0 %	15611075
50	NC_000921	ATTC	2	8	2389	2396	25 %	50 %	0 %	25 %	15611075
51	NC_000921	A	8	8	2580	2587	100 %	0 %	0 %	0 %	15611076
52	NC_000921	TCTT	2	8	2596	2603	0 %	75 %	0 %	25 %	15611076
53	NC_000921	T	6	6	2677	2682	0 %	100 %	0 %	0 %	15611076
54	NC_000921	T	7	7	2718	2724	0 %	100 %	0 %	0 %	15611076
55	NC_000921	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611076
56	NC_000921	GC	3	6	2829	2834	0 %	0 %	50 %	50 %	15611076
57	NC_000921	A	6	6	2867	2872	100 %	0 %	0 %	0 %	15611076
58	NC_000921	AG	3	6	2986	2991	50 %	0 %	50 %	0 %	15611076
59	NC_000921	GTG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611076
60	NC_000921	AGA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611076
61	NC_000921	CAAA	2	8	3139	3146	75 %	0 %	0 %	25 %	15611076
62	NC_000921	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611076
63	NC_000921	GAAA	2	8	3285	3292	75 %	0 %	25 %	0 %	15611077
64	NC_000921	GAAA	2	8	3360	3367	75 %	0 %	25 %	0 %	15611077
65	NC_000921	TG	3	6	3467	3472	0 %	50 %	50 %	0 %	15611077
66	NC_000921	AAGCA	2	10	3530	3539	60 %	0 %	20 %	20 %	15611077
67	NC_000921	GTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611077
68	NC_000921	ATC	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611077
69	NC_000921	GCGATA	2	12	3764	3775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15611077
70	NC_000921	TG	3	6	3798	3803	0 %	50 %	50 %	0 %	15611077
71	NC_000921	AGAA	2	8	3816	3823	75 %	0 %	25 %	0 %	15611077
72	NC_000921	A	6	6	3854	3859	100 %	0 %	0 %	0 %	15611077
73	NC_000921	ATAG	2	8	3871	3878	50 %	25 %	25 %	0 %	15611077
74	NC_000921	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	15611077
75	NC_000921	A	6	6	3927	3932	100 %	0 %	0 %	0 %	15611077
76	NC_000921	ATT	2	6	3944	3949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611077
77	NC_000921	TGT	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611077
78	NC_000921	TGG	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611077
79	NC_000921	TCGC	2	8	5572	5579	0 %	25 %	25 %	50 %	15611078
80	NC_000921	T	6	6	5580	5585	0 %	100 %	0 %	0 %	15611078
81	NC_000921	CATT	2	8	5645	5652	25 %	50 %	0 %	25 %	15611078
82	NC_000921	ATT	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
83	NC_000921	C	6	6	5730	5735	0 %	0 %	0 %	100 %	15611078
84	NC_000921	TGG	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611078
85	NC_000921	A	6	6	5877	5882	100 %	0 %	0 %	0 %	15611078
86	NC_000921	A	6	6	5919	5924	100 %	0 %	0 %	0 %	15611078
87	NC_000921	TTGT	2	8	5925	5932	0 %	75 %	25 %	0 %	15611078
88	NC_000921	TTG	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
89	NC_000921	TAA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611078
90	NC_000921	TTA	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
91	NC_000921	GTG	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611078
92	NC_000921	GTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
93	NC_000921	GC	3	6	6225	6230	0 %	0 %	50 %	50 %	15611078
94	NC_000921	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611078
95	NC_000921	TGT	2	6	6284	6289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
96	NC_000921	C	6	6	6329	6334	0 %	0 %	0 %	100 %	15611078
97	NC_000921	GTT	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
98	NC_000921	T	6	6	6435	6440	0 %	100 %	0 %	0 %	15611078
99	NC_000921	GCTTGC	2	12	6469	6480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611078
100	NC_000921	CAG	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611078
101	NC_000921	GCG	2	6	6542	6547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611078
102	NC_000921	AC	3	6	6651	6656	50 %	0 %	0 %	50 %	15611078
103	NC_000921	GC	3	6	6683	6688	0 %	0 %	50 %	50 %	15611078
104	NC_000921	TGATTG	2	12	6703	6714	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15611078
105	NC_000921	CTT	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611078
106	NC_000921	TAG	8	24	6785	6808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611078
107	NC_000921	TTA	2	6	6817	6822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611078
108	NC_000921	GTT	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
109	NC_000921	TTG	2	6	6909	6914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
110	NC_000921	GTT	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
111	NC_000921	TGT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
112	NC_000921	CCG	2	6	7112	7117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611078
113	NC_000921	T	6	6	7160	7165	0 %	100 %	0 %	0 %	15611078
114	NC_000921	ATCG	2	8	7200	7207	25 %	25 %	25 %	25 %	15611078
115	NC_000921	GCT	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611078
116	NC_000921	CGTT	2	8	7235	7242	0 %	50 %	25 %	25 %	15611078
117	NC_000921	GTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611078
118	NC_000921	T	6	6	7308	7313	0 %	100 %	0 %	0 %	15611078
119	NC_000921	A	6	6	7374	7379	100 %	0 %	0 %	0 %	15611078
120	NC_000921	GA	6	12	7413	7424	50 %	0 %	50 %	0 %	15611078
121	NC_000921	T	7	7	7434	7440	0 %	100 %	0 %	0 %	15611078
122	NC_000921	CAT	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611079
123	NC_000921	GCC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
124	NC_000921	TCT	2	6	7828	7833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
125	NC_000921	GAAACC	2	12	7876	7887	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15611079
126	NC_000921	AAT	2	6	7926	7931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611079
127	NC_000921	CTT	2	6	7934	7939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
128	NC_000921	TTCA	2	8	8004	8011	25 %	50 %	0 %	25 %	15611079
129	NC_000921	CCA	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611079
130	NC_000921	GC	3	6	8071	8076	0 %	0 %	50 %	50 %	15611079
131	NC_000921	ATG	2	6	8077	8082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
132	NC_000921	TCA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611079
133	NC_000921	CG	3	6	8136	8141	0 %	0 %	50 %	50 %	15611079
134	NC_000921	CCG	2	6	8155	8160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
135	NC_000921	CTT	2	6	8174	8179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
136	NC_000921	CCG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
137	NC_000921	T	6	6	8223	8228	0 %	100 %	0 %	0 %	15611079
138	NC_000921	AG	3	6	8283	8288	50 %	0 %	50 %	0 %	15611079
139	NC_000921	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611079
140	NC_000921	TTC	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611079
141	NC_000921	TGA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611079
142	NC_000921	CCG	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611079
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